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[建言献策] 传统结构生物学被AI挤兑后遭遇系统性失业

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楼主
发表于 2022-11-3 12:06 | 只看该作者 |只看大图 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式 | 来自四川
第一部分
回归正题,因为结构生物学饭碗快丢了
先做个比喻:)
颜宁施一公的工作=手工织衣服

DeepMind的AlphaFold=珍妮纺织机

前者是优秀的裁缝,有着良好的纺织技术训练,也有良好的裁缝铺和裁缝界声望,但局限于产量和效率,已经达到天花板。

后者则是革命性技术推动,早期可能衣服还没裁缝好,但是使效率提升百万倍,后期改进空间极大,潜力也无限。

颜宁教授及其学生,从原本解析结构,今后可能变成验证结构的正确性。不太恰当的自嘲。类似于从算法岗位降级成为测试岗位,最后降为数据专员。

在全世界最强的AI公司,英国DeepMind的
AlphaFold2出来之前,颜宁和施一公尚能在在其领域呼风唤雨。
本来颜宁他们一年能解析几十个蛋白质”(以为可以靠这个一直有饭吃)
可是AlphaFold2从本质上改变了这一切:(

DeepMind:劳资一次给解析“2亿个结构”,2亿个!几乎把地球上的蛋白质全部覆盖!

Number of Pretein Structures

AiphaFald Dl today200M+ Structure

Aichafold DB pr1M Structure

知乎 @多崎作

这么几十年,所有的几千名结构生物学家才解析19万个蛋白质,DeepMind一年直接上亿,打破了原有的行业发展。

引用知乎某大佬的话:@谢流远

1)DeepMind的Alphafold2,虽然目前还不能解决所有结构生物学问题,只能覆盖部分情况,但是计算领域的发展速度是指数级的。相比于线性发展的传统学科,一旦跨过临界点。大部分被计算替代只是时间问题。"

2)DeepMind展示了工业化集团攻关的科研形式,相对于传统的一个教授(领主)带几个学生(佃农)的封建式科研形式9的优越性理工科研发展到现在生产关系已经在抑制生产力发展了,急需改革。
至AlphaFold2问世之后,各钟投资人,政府机构原本拨给传统结构生物学的90%以上的经费,划拨给生物AQ的实验室,各大期刊论
文,国际会议进一步改革,导致传统结构生物学变成Engineering的活,原本NatureScience给各类研究审稿期7个月到1年以上,现在给 DeepMind特权,2个月优先审稿,优先发表。政策和资本倾向性已经很明显。

世间几乎所有已知蛋白质结构、都被DeepMind开源了
mp.weixingg.com/s/20HSNtaSBr

在传统结构生物学被AI挤兑系统性失业后,大部分人呢,转战商业编故事骗人。
第二部分

如何看待颜宁宣布即将辞去普林斯顿大学教职,全职回国,出任深圳医学科学院创始院长?
知乎166个回答·449关注>
多崎作 +关注
回答突然火了,在此澄清一下、此处绝无恶意抹黑颜宁教授和施一公教授。
先说结论:在轰轰烈烈的AI革命下,传统结构生物学Q的颜宁教授,在欧美的竞争力大幅下降,从而走到了职业天花板和科研天花板。
论文方面:顶刊数量暴跌,可以从其Nature ScienceCell的论文进行统计:2015年-2018年保持3篇以上,19年5篇达顶峰,2020年4篇,2021年2篇,今年2022年已经到11月了,目前只有一篇,科研产出也大幅下降。
项目资金:funding申请不顺,19年一个项目41万美金,2020年3个项目分别是20万美金32万美金,19万美金,2021年两个项目分别是33万美金,2022年两个项目分别是37万美金.33万美金。要知道一个美国博士生培养
funding,每年算上器材10万美金,招5个博士就是50万美金+,颜宁这个不能说少吧,但相比于顶校大佬动则200万-2000万美金的 funding,颜宁这个确实有点囊中羞涩。
知乎@多锅作
所以回国商业化变现和提升title,是目前她认知范围内的局部最优解,参考她之前频繁变动的工作环境,可以明白她一直在横跳,保障利益最大化。
颜宁回国对于国家是极好的事情。能带动传统生物学。发展,也可以激励更多女性科学家。但也必须看到她当下研究的局限性,以及科研价值大幅贬值性。
不是颜宁教授不行,而是英国DeepMind太强大了,他们本来就是全世界的科技最顶级的存在,这个公司聚集了1000+的世界顶级科学家,其中不乏各个顶级大学的顶级教授,还有每年全球最优秀的毕业生。
颜宁教授看待AlphaFold这个事情,就像骁勇善战的野蛮人首领看到了航空母舰。

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